A obra do novo Pronto-Socorro do Hospital das Clínicas de Botucatu entrou na fase de acabamento. Em junto de 2007, a diretoria da Faculdade de Medicina da UNESP/Botucatu realizou assinatura do contrato de construção dessa nova estrutura de atendimento, no campus de Rubião Júnior, em terreno ao lado do atual PS. Desde então os trabalhos prosseguem.
A obra foi viabilizada pela destinação de recursos do Ministério da Saúde por intermédio de emenda parlamentar apresentada pelo deputado federal Milton Monti. O investimento previsto é de 2 milhões de reais, sendo 1,5 milhão do MS e cerca de 500 mil reais de recursos próprios da Faculdade de Medicina e da UNESP.
O PS da Unesp atende casos de alta complexidade. Toda a regional de Botucatu é atendida pela assistência médica da Unesp.