A obra do novo Pronto-Socorro do Hospital das Clínicas de Botucatu entrou na fase de acabamento. Em junto de 2007, a diretoria da Faculdade de Medicina da UNESP/Botucatu realizou assinatura do contrato de construção dessa nova estrutura de atendimento, no campus de Rubião Júnior, em terreno ao lado do atual PS. Desde então os trabalhos prosseguem.A obra foi viabilizada pela destinação de recursos do Ministério da Saúde por intermédio de emenda parlamentar apresentada pelo deputado federal Milton Monti. O investimento previsto é de 2 milhões de reais, sendo 1,5 milhão do MS e cerca de 500 mil reais de recursos próprios da Faculdade de Medicina e da UNESP.
O PS da Unesp atende casos de alta complexidade. Toda a regional de Botucatu é atendida pela assistência médica da Unesp.